离子交换层析有很高的生物分子交换能力。所以往往选择它作为纯化的第一步。 通过改变盐浓度、盐类型、 pH值、树脂种类，离子交换层析可以表现出很高的结合能力和洗脱选择性。所以它也可以被用作纯化的中间步骤。离子交换层析的一个重要特性是它能浓缩结合组分。离子交换层析可用来处理非常稀的样品液，捕获目标分子。

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离子交换介质是目前蛋白分离纯化中应用最广泛的方法之一，既可用于捕获初分离，也可用于中度纯化与精细纯化。 操作简单，流动相便宜，蛋白活性回收率高。

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离子交换层析（IEC）是各种层析技术中应用最广的一种，它是通过带电的溶质分子与离子交换层析介质上可交换的离子基团通过交换而达到分离纯化的方法，也可认为是蛋白质分子中带电的氨基酸残基与带相反电荷的层析介质的骨架相互作用达到分离纯化的方法。

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用于超大生物分子（如疫苗、多肽、PEG修饰蛋白等）快速、高效的分离纯化。

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